Después de la caída del Imperio Inca en 1534 los conquistadores españoles tomaron el poder sobre los territorios convirtiéndose en el nuevo elite encargado. Casi tres siglos de la historia ecuatoriana pertenecen al período colonial y llevan la marca de una mezcla continua entre la gente europea e indígena por un lado y entre sus culturas por otro. A consecuencia se ha creado una nueva cultura que se diferencia de ambas europea e indígena.

Durante el período colonial se manifestaba una prosperidad de las artes bellas cuya evidencia son numerosas obras de la pintura y de la escultura, se construían también templos y monasterios. Personas muy destacadas y eminentes como Charles Marie de la Condamine, geógrafa y matemático francés, y Alexander Von Humboldt, historiógrafa y científico alemán, cruzaban el Océano Atlántico para encargarse de las exploraciones.

En el año 1563 del período colonial Ecuador se convirtió en la sede del Público Real de Quito. El motivo principal para las Guerras de Independencia en América del Sur era la política demasiado colonial del gobierno central. Los criollos fueron privados de puestos muy importantes en el gobierno y animados por la idea de la revolución francesa y la norteamericana, provocaron un descontento total en la población.